No ensino secundário, o CMB disponibiliza seguinte oferta educativa:
Curso Secundário de Música, variante instrumental de: Acordeão; Canto; Clarinete; Contrabaixo; Fagote; Flauta Transversal; Guitarra; Oboé, Órgão; Piano; Percussão; Saxofone; Trombone; Trompa; Trompete; Violeta; Violino; Violoncelo.
Curso Secundário de Música, variante Composição.
Curso Secundário de Música, variante Formação Musical.
Curso Secundário de Canto.
O acesso aos cursos secundários de Música faz-se mediante a realização de uma prova de acesso.
Os cursos secundários de Música funcionam em regime articulado e supletivo.